背景
天津某高层框架剪力墙结构建筑，地下2层，地上18层。由于地质条件不太理想，所有柱及墙底均设计有D=800mm的泥浆护壁灌注桩加桩承台基础、地连梁，地下室底板为整体筏板。施工过程中发生了以下事件：
事件一：成孔后清孔换浆，测定桩底沉渣厚度合格，然后下放钢筋笼、导管，并按水下混凝土施工工艺浇筑混凝土，浇筑混凝土均超出设计桩顶标高300mm。
事件二：监理工程师对成桩进行检查，发现⑧-D轴交汇处某桩成桩直径不足800mm，实测值为760mm，且桩位偏差为113mm。
事件三：监理工程师查阅相关资料显示，所有桩身混凝土试件检验均合格，并进行承载力试验，所有桩承载力检测均符合设计及相关规范要求。
事件四：竣工验收前，施工单位将所有工程档案提请当地城建档案管理机构进行预验收，合格后提请建设单位正式组织竣工验收。建设单位技术负责人组织施工单位、监理单位、设计单位和勘察单位共赴现场进行竣工验收，验收获得通过。

背景资料：
某酒店工程，建筑面积28700m2，地下1层，地上15层，现浇钢筋混凝土框架结构。建设单位依法进行招标，投标报价执行《建设工程工程量清单计价规范》GB50500—2013。共有甲、乙、丙等8家单位参加了工程投标。经过公开开标、评标，最后确定甲施工单位中标。建设单位与甲施工单位按照《建设工程施工合同（示范文本）》GF—2013—0201签订了施工总承包合同。
合同部分条款约定如下：（1）本工程合同工期549d；（2）本工程采取综合单价计价模式；（3）包括安全文明施工费的措施费包干使用；（4）因建设单位责任引起的工程实体设计变更发生的费用予以调整；（5）工程预付款比例为10%。
工程投标及施工过程中，发生了下列事件：
事件一：在投标过程中，乙施工单位在自行投标总价基础上下浮5%进行报价。评标小组经认真核算，认为乙施工单位报价中的部分费用不符合《建设工程工程量清单计价规范》中不可作为竞争性费用条款的规定，给予废标处理。
事件二：甲施工单位投标报价书情况是：土石方工程量650m3，定额单价人工费为8.40元/m3、材料费为12.00元/m3、机械费1.60元/m3。分部分项工程量清单合价为8200万元，措施费项目清单合价为360万元，暂列金额为50万元，其他项目清单合价120万元，总包服务费为30万元，企业管理费15%，利润为5%，规费为225.68万元，税金为3.41%。
事件三：甲施工单位与建设单位签订施工总承包合同后，按照《建设工程项目管理规范》GB/T50326--2006进行了合同管理工作。
事件四：甲施工单位加强对劳务分包单位的日常管理，坚持开展劳务实名制管理工作。
事件五：施工进行到第13个月时，因建设单位设计变更导致某工作延期2个月，造成施工总承包单位施工机械停工损失费13000元和该施工机械操作人员窝工费2000元。
该工作的延期并未影响总工期，但施工总承包单位仍提出上述两项费用索赔。

某实施施工监理的工程，建设单位按照《建设工程施工合同（示范文本）》（GF-2013-0201）与甲施工单位签订了施工总承包合同。合同约定：开工日期为2011年3月1日，工期为302d。建设单位负责施工现场外道路开通及设备采购；设备安装工程可以分包。
经总监理工程师批准的施工总进度计划如下图所示。

工程实施中发生了下列事件：
事件1：由于施工现场外道路未按约定时间开通，致使甲施工单位无法按期开工。2013年2月21日，甲施工单位向项目监理机构提出申请，要求开工日期推迟3d，补偿延期开工造成的实际损失3万元。经专业监理工程师审查，情况属实。
事件2：C工作是土方开挖工程。土方开挖时遇到了难以预料的暴雨天气，工程出现重大安全事故隐患，可能危及作业人员安全，甲施工单位及时报告了项目监理机构。为处理安全事故隐患，C工作实际持续时间延长了12d。甲施工单位申请顺延工期12d、补偿直接经济损失10万元。
事件3：F工作是主体结构工程，甲施工单位计划采用新的施工工艺，并向项目监理机构报送了具体方案，经审批后组织了实施。结果大大降低了施工成本，但F工作实际持续时间延长了5d，甲施工单位申请顺延工期5d。
事件4：甲施工单位将设备安装工程（J工作）分包给乙施工单位，分包合同工期为56d。乙施工单位完成设备安装后，单机无负荷试车没有通过，经分析是设备本身出现问题。经设备制造单位修理，第二次试车合格。由此发生的设备拆除、修理、重新安装和重新试车的各项费用分别为2万元、5万元、3万元和1万元，J工作实际持续时间延长了24d。乙施工单位向甲施工单位提出索赔后，甲施工单位遂向项目监理机构提出了顺延工期和补偿费用的要求。

某施工单位通过公开招标中标某工程，与业主签订的承包合同部分内容有：
（1）工程合同总价2100万元，工程价款采用调值公式动态结算；该工程的人工费可调，占工程价款的35%；材料有4种可调：材料1占5%，材料2占15%，材料3占15%，材料4占10%；不调值费用占工程价款的20%。价格指数如下：

开工前业主向承包商支付合同价的15%作为预付备料款，主要材料及构配件金额占合同总额的65%。竣工前全部结清。
（2）工程进度款逐月结算。
（3）本工程采用固定单价合同计价模式，当实际工程量增加或减少超过清单工程量的5%时，合同单价予以调整，调整系数为0.95或1.05。
合同履行过程中，施工单位对清单工程量进行了复核。其中：钢筋实际工程量为9600t，钢筋清单工程量为10176t（清单报价为5800元/工）；土方实际工程量为30240m³，土方清单工程量为28000m³（清单报价为32元/m³）。施工单位向建设单位提出钢筋与土方工程的价款调整报告。
问题

某市单层钢结构厂房工程，基础部分采用锤击打入预应力管桩、部分采用泥浆护壁灌注桩。桩承台上预埋地脚螺栓与钢柱连接。
预应力管桩打入过程中，发现桩身突然倾斜错位，经查桩尖处土质条件没有特殊变化，而贯入度突然增大；同时，当桩锤跳起后，桩身随之出现回弹现象。
泥浆护壁灌注桩施工过程中，频繁出现孔壁坍落现象。
桩承台及预埋地脚螺栓均施工完毕，安装钢柱时发现钢柱底部预留螺栓孔与预埋螺栓不对中。